Para determinar sua utilidade na detecção do CHC, avaliamos o ensaio HCCScreen nos indivíduos que têm um diagnóstico conhecido de CHC ou foram excluídos (não-HCC). Obtivemos 65 casos de CHC e 70 casos não-HCC dos indivíduos AFP/US-positivos/suspeitos. Esse status positivo para HCC ou HCC negativo foi baseado em imagens dinâmicas de CT/RM e confirmação histológica.

Esses 135 casos foram utilizados como coorte de treinamento e os resultados da tela HCC foram comparados com o diagnóstico clínico. Para construir um classificador que integra diferentes tipos de biomarcadores no ensaio, primeiro colapsamos os diferentes tipos de mutações no cfDNA em uma pontuação na região de interesse (ROI) para cada gene ou locus (consulte Métodos). A pontuação do ROI foi uma soma ponderada dos efeitos e frequência prejudiciais para cada mutação pontual dentro de um ROI.