Kuamua matumizi yake katika ugunduzi wa HCC, tulipima assay ya HCCScreen kwa watu ambao wana utambuzi unaojulikana wa HCC au wametengwa (non-HCC). Tulipata kesi 65 za HCC na kesi 70 zisizo za HCC kutoka kwa watu wa AFP/US-chanya/watuhumiwa. Hali hii ya HCC-chanya au HCC-hasi ilikuwa msingi wa nguvu ya mawazo ya CT/MRI na uthibitisho wa kihistoria.

Kesi hizi 135 zilitumika kama kikundi cha mafunzo, na matokeo ya HCCScreen yalilinganishwa na utambuzi wa kliniki. Ili kujenga mwanafunzi anayejumuisha aina tofauti za biomarkers kwenye assay, kwanza tulianguka aina tofauti za mabadiliko ya cFDNA kuwa alama ya Mkoa wa Riba (ROI) kwa kila jeni au locus (tazama njia). Alama ya ROI ilikuwa jumla ya athari ya uharibifu na frequency kwa kila mabadiliko ya uhakika ndani ya ROI.