Ili kubainisha matumizi yake katika ugunduzi wa HCC, tulitathmini upimaji wa skrini ya HCC kwa watu ambao wana utambuzi unaojulikana wa HCC au ambao wametengwa (wasio wa HCC). Tulipata kesi 65 za HCC na kesi 70 zisizo za HCC kutoka kwa watu binafsi wa AFP/US-chanya/walioshukiwa. Hali hii ya HCC-chanya au HCC-hasi ilitokana na taswira thabiti ya CT/MRI na uthibitisho wa kihistoria.

Kesi hizi 135 zilitumika kama kundi la mafunzo, na matokeo ya skrini ya HCC yalilinganishwa na uchunguzi wa kimatibabu. Ili kuunda kiainishaji kinachounganisha aina tofauti za viashirio vya kibayolojia katika jaribio, kwanza tulikunja aina tofauti za mabadiliko ya cfDNA katika alama ya eneo la riba (ROI) kwa kila jeni au locus (angalia Mbinu). Alama ya ROI ilikuwa jumla ya uzani wa athari za uharibifu na frequency kwa kila ubadilishaji wa nukta ndani ya ROI.