Selle kasulikkuse kindlaksmääramiseks HCC tuvastamisel hindasime HCC-sõeluuringut isikutel, kellel on teadaolev HCC diagnoos või kes on välja jäetud (mitte-HCC). AFP/USA-positiivsetelt/kahtlustatavatelt isikutelt saime 65 HCC juhtumit ja 70 mitte-HCC juhtumit. See HCC-positiivne või HCC-negatiivne staatus põhines dünaamilisel CT/MRI-kuvamisel ja histoloogilisel kinnitusel.

Neid 135 juhtumit kasutati koolituskohordina ja HCC-sõeluuringu tulemusi võrreldi kliinilise diagnoosiga. Analüüsis erinevat tüüpi biomarkereid integreeriva klassifikaatori loomiseks alandasime esmalt erinevat tüüpi cfDNA mutatsioonid iga geeni või lookuse jaoks huvipakkuva piirkonna (ROI) skooriks (vt meetodid). ROI skoor oli ROI iga punktmutatsiooni kahjustavate mõjude ja sageduse kaalutud summa.