Upang matukoy ang utility nito sa pagtuklas ng HCC, sinuri namin ang hccscreen assay sa mga indibidwal na may kilalang diagnosis ng HCC o hindi kasama (non-HCC). Nakuha namin ang 65 mga kaso ng HCC at 70 mga kaso na hindi HCC mula sa mga indibidwal na AFP/US-positibo/pinaghihinalaang. Ang katayuan ng HCC-positibo o HCC-negatibong katayuan ay batay sa dynamic na imaging CT/MRI at kumpirmasyon ng histologic.

Ang mga 135 kaso na ito ay ginamit bilang cohort ng pagsasanay, at ang mga resulta ng hccscreen ay inihambing sa diagnosis ng klinikal. Upang makabuo ng isang classifier na pagsasama ng iba't ibang uri ng mga biomarker sa assay, una naming gumuho ang iba't ibang uri ng mga mutasyon ng cfDNA sa isang marka ng rehiyon ng interes (ROI) para sa bawat gene o locus (tingnan ang mga pamamaraan). Ang marka ng ROI ay isang bigat na kabuuan ng mga nakasisirang epekto at dalas para sa bawat mutation ng point sa loob ng isang ROI.